В Санкт-Петербургской школе № 106 на двери одного из классных кабинетов находится памятная дощечка с надписью: «Здесь училась героическая партизанка Лариса Михеенко». За специальной «Лариной партой» в этом кабинете сидят лучшие ученики. Имя Ларисы Михеенко также носила пионерская дружина этой школы.
В средней школе № 5 города Хотьково Московской области, пионерская дружина которой также носила имя Ларисы, с 1961 года действует Народный музей им. Лары Михеенко. В школьном дворе установлен памятник юной партизанке.
В честь Лары Михеенко названы улицы в нескольких населённых пунктах России, в том числе в Хотьково, посёлках Рахья, Бежаницы, Ушково и др.
Одному из морских пассажирских судов СССР было присвоено имя Ларисы Михеенко.
В средней школе №5 поселка Краснореченский, Дальнегорского района, Приморского края, пионерская дружина носила имя Лары Михеенко, установлена памятная стелла во дворе школы, приезжала даже мама Ларисы Михеенко в гости.