В провинциальный городок приезжает таинственный столичный маг Игорь Келдыш и устраивается в обыкновенную школу учителем истории магии. Харизматичный, привлекательный и, к тому же, умеющий заинтересовать аудиторию даже, казалось бы, весьма скучными историческими фактами, молодой преподаватель сразу становится кумиром всех девчонок и авторитетом для всех остальных, вплоть до пожилых педагогов.
Однако почему-то он буквально с первого взгляда невзлюбил Агату Мортимер, тихоню и синего чулка, недоумевающую по поводу этой упорной неприязни. Агате приходится терпеть постоянные придирки преподавателя, кроме того, его предвзятое отношение к ней усугубляет и без того глубокий разрыв между девочкой и её одноклассниками. (Не то, чтобы ей действительно было, о чём с ними общаться, но кому понравится терпеть дразнилки?) Во время школьной экскурсии в Столицу (в сопровождении Келдыша) она случайно демонстрирует ему свою способность безмолвно общаться с животными, во время отдыха в столичном сквере заигравшись с рыбкой, и, что еще хуже, во время экскурсии по музею магии слышит Котёл - феномен магического происхождения, оставшийся после магической войны. Несмотря на это, даже тщательная проверка не обнаруживает у Агаты никаких магических способностей. Вернувшись домой, Агата наконец выясняет источник неприязни Келдыша. Выясняется, что её родители - чета Мортимер - были величайшими магами, из-за которых и началась магическая война. Их неудачные эксперименты и последовавшие за ними события привели к огромным жертвам среди населения. Оказывается, Келдыш - Ловец из Службы Контроля Магии и сражался в той войне против четы Мортимер и их последователей. Он не может поверить, что дочь великих магов (хоть и преступников) и внучка железной Лидии Мортимер на самом деле не маг. Из-за своих подозрений Келдыш добивается кураторства над Агатой и уговаривает её провериться у Слухача. Их поход в лавку Слухача чуть не заканчивается трагически, но всё же им удаётся выяснить, что в Агате живут отголоски мортимеровской магии и что девочка является Ключом, что бы это ни значило.
Однажды, спустя некоторое время, на Агату и Келдыша нападают неизвестные маги. Они похищают Агату, как ей кажется, убив Игоря. Потом выясняется, что её похитители - последователи Мортимеров, ярые противники ограничений и контроля магов. В их убежище она встречает собственного лишённого магии отца, который отказывается признавать в обычном человеке свою дочь. Выясняется, что рождение Агаты послужило стимулом для экспериментов по превращению не-магов в магов. Агате удаётся сбежать от похитителей, но вскоре её находит куратор и уводит прятаться в катакомбы под Столицей. Там их находит начальник Игоря из СКМ. Несмотря на недоверие девочке, Ловец скрывает от начальника немаловажные факты касательно "Ключа" и "отголосков магии", а потом уводит её в одну из своих конспиративных квартир, объясняя свою заботу исследовательским интересом. Ловец не верит, что, если он передаст девочку в руки СКМ, её когда-нибудь выпустят из исследовательской лаборатории. Однако вскоре происходит непредвиденное возмущение Котла, и, хоть тревога и оказалась ложной, Ловец решает передать девочку СКМ. Тогда Агата сбегает от куратора к Котлу, намереваясь вынудить обе стороны (повстанцев и СКМ) оставить её в покое. В ходе неудачных, напряжённых переговоров девочка принимает решение спрыгнуть в котлован. Там она выпускает магию в мир, но не остаётся без подарка: Котёл на прощание наделяет Агату магической силой.
В результате Агату помещают в интернат для магически одаренных детей, испытывающих трудности с управлением способностями. Куратор же, по настоянию собственного начальника и бабушки Агаты, отдаляется от подопечной, вдобавок демонстрируя ей свою незаинтересованность в общении, представив своей любовнице. Теперь Агате предстоит в одиночку учиться общению со сверстниками и овладевать собственной "мерцающей" магией, которая проявляется только в моменты эмоционального всплеска.
